Як цитувати
Анотація
DISTRIBUTION OF THE CAUSATIVE AGENTS OF RESPIRATORY TRACT INFECTIONS IN CHILDREN.
Mishyna М., Gonchar M., Logvinova O., Isaieva H., Basiuk M.
The study aimed to investigate prevalence of microorganisms depending on the site of isolation and disease. The study involved 48 children aged 1 year to 17 years. Acute bronchitis (54, 17%), community-acquired pneumonia (CAP) (33, 33%), bronchial asthma (12, 50%) were diagnosed. Were isolated 173 strains of microorganisms. Gram-positive microorganisms were detected 106 strains (61, 3%), Gram-negative microorganisms - 49 strains (28, 3%), fungi - 18 strains (10, 4%). We investigated 100 samples from nose (nasal swabs), pharynx (throat swabs) and sputum. In 83 cases were isolated Gram-positive microorganisms, in 36 cases were isolated Gram-negative microorganisms, in 18 cases - fungi. Analysis reviled that Staphylococcus aureus most often isolated from patients with acute bronchitis; Gram-negative microorganisms most often detected from throat swabs, comparing with microorganisms detected from nose swabs and sputum.
Keywords: microorganisms, biofilms, respiratory diseases, children.
Анотація
ПОШИРЕНІСТЬ ЗБУДНИКІВ ІНФЕКЦІЙ ДИХАЛЬНИХ ШЛЯХІВ У ДІТЕЙ.
Мішина М.М, Гончарь М. О., Логвінова О.Л., Ісаєва Г.О., Басюк М.А.
Метою дослідження було вивчити переважання умовно-патогенних мікроорганізмів, які викликають захворювання органів дихання у дітей, в залежності від місця виділення та захворювання. У дослідженні було 48 дітей у віці від 1 року до 17 років. Пацієнти були з такими діагнозами: гострі бронхіти (54, 17%), негоспітальні пневмонії (33, 33%), бронхіальна астма (12, 50%). Було виділено 173 штама умовно-патогенних мікроорганізмів. Грампозитивних мікроорганізмів було виділено 106 штамів (61, 3%), грамнегативних мікроорганізмів – 49 штамів (28, 3%), грибів – 18 штамів (10, 4%). Було досліджено 100 зразків з зіву, носу, мокротиння. Грампозитивні мікроорганізми були виділені з 83 зразків, грамнегативні – з 36 зразків, гриби – з 18 зразків. Проведене дослідження довело, що Staphylococcus aureus найчастіше виділявся у пацієнтів з гострими бронхітами. Грамнегативні мікроорганізми частіш за все виділялись зі зразків із зіву в порівнянні з мазками з носу та мокротинням.
Ключові слова: мікроорганізми, біоплівки, захворювання органів дихання, діти.
Абстракт
РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ИНФЕКЦИЙ ДЫХАТЕЛЬНЫХ ПУТЕЙ У ДЕТЕЙ.
Мішина М.М., Гончарь М. О., Логвінова О.Л., Ісаєва Г.О., Басюк М.А.
Целью исследования было изучить преобладание условно-патогенныхмикроорганизмов, вызывающих заболевания органов дыхания у детей, в зависимости от места забора материала и заболевания. Исследование включало 48 детей в возрасте от 1 года до 17 лет. Пациенты находились с такими заболеваниями: острые бронхиты (54, 17%), внегоспитальные пневмонии (33, 33%), бронхиальная астма (12, 50%). Всего было выделено 173 штамма условно-патогенных микроорганизмов. Грамположительных микроорганизмов было выделено 106 штаммов (61, 3%), грамотрицательных микроорганизмов – 49 штаммов (28, 3%), грибов – 18 штаммов (10, 4%). Было исследовано 100 образцов из зева, носа, мокроты. Грамположительные микроорганизмы были выделены из 83 образцов, грамотрицальные – из 36 образцов, грибы – из 18 образцов. В ходе исследования было доказано, что Staphylococcus aureus чаще всего выделялся от пациентов с острыми бронхитами. Грамотрицательные микроорганизмы чаще всего выделялись из мазков из зева по сравнению с мазками из носа и мокротой.
Ключевые слова: микроорганизмы, биопленки, заболевания органов дыхания, дети.
Посилання
Liu L., Johnson H.L., Cousens S., Perin J., Scott S., Lawn J.E., Rudan I., Campbell H., … Black R.E., (2012). Global, regional, and national cases of child mortality: an update systemic analysis for 2010 with time trends since 2000. Lancet, 379(9832), 2151-2161. doi: 10.1016/S0140-6736
http://dx.doi.org/10.1016/S0140-6736
Koppen I., Bosch A., Sanders E., van Houten M., Bogaert D., (2015). The respiratory microbiota during health and disease: a paediatric perspective. pneumonia, 6(1), 90-100. doi:10.1572/pneu.2015.6/656
Sakwinska O., Bastic Schmid V., Berger B., Bruttin A., Keitek K., Lepage M., et al. (2014) Nasopharyngeal microbiota in healthy children and pneumonia patients. Journal of Clinical Microbiology 52(5):1590- 1594. doi:10.1128/JCM.03280-13 http://dx.doi.org/10.1128/JCM.03280-13
Charalambous B.M., Leung M.H. (2012) Pneumococcal sepsis and nasopharyngeal carriage. Current opinion in pulmonary medicine.18(3) 222-227
https://doi.org/10.1097/MCP.0b013e328352103b.
Marks L.P., Reddinger R.M., Hakansson A.P., (2012) High levels of genetic recombination during nasopharyngeal carriage and biofilm formation in Streptococcus pneumonia. mBio 3(5), e0200-12. doi: 10.1128/mBio.0200-12
https://doi.org/10.1128/mBio.00200-12.
Marks L.R., Reddinger R.M., Hakansoon A.P. (2014) Biofilm formation enhances fomite survival of Streptococcus pneumonia and Streptococcus pyogenes. Infection and immunity 82(3), 1141-1146. doi:10.1128/IAI.01310-13
https://doi.org/10.1128/IAI.01310-13.
Reddinger R.M., Luke-Marshall N.R., Sauberan S.L., Hakansson A.P., Campagnaria A.A., (2018) Streptococcus pneumonia modulates Staphylococcus aureus biofilm dispersion and the transmission from colonization to invasive disease. mBio 9(1), e02089-17.
van den Bergh M.R., Biesbroek G., Rossen J.W., de Steenhuijsen Piters W.A., Bosch A.A., van Gils E. J., … Sanders E.A., (2012). Association between pathogens in the upper respiratory tract of young children: interplay between viruses and bacteria. PLoS One, 7(10), e47711
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0047711.
Bosch A.A., Biesbroek A.A., Trzcinski K., Sanders E.A., Bogaert D., (2013). Viral and bacterial interactions in the upper respiratory tract. PLoS One, 9(1), e1003057. doi:10.1371/journal.ppat.1003057
https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003057.
Wertheim H.F., Vos M.C., Ott A., van Belkum A., Voss A., Kluytmans J.A., van Keulen P.H., Vandenbroucke-Grauls C.M., … Verbrugh H.A., (2004). Risk and outcome of nosocomial Staphylococcus aureus bacteraemia in nasal carriers versus non-carriers. Lancet. 364(9435), 703-705. doi: 10.1016/S0140-6736(04)16897-9 https://doi.org/10.1016/S0140-6736(04)16897-9.
Esposito S., Terranova L., Zampiero A., Ierardi V., Rios W.P., Pelucchi C., Principi N., (2014). Oropharyngeal and nasal Staphylococcus aureus carriage by healthy children. BMC Infectious Diseases.14:723. doi:10.1186/s12879-014-0723-9. https://doi.org/10.1186/s12879-014-0723-9.
Soares A.C., Souza D.G., Pinho V., Vieira A.T., Nicoli J.R., Cunha F.G., Mantovani A., Reis L.F., … Teixeira M.M., (2006). Dual function of the long pentraxin PTX3 in resistance against pulmonary infection with Klebsiella pneumonia in transgenic mice. Microbes and infection.8(5).
doi:10.1016/j.micinf.2005.12.017
Zhang P., Summer W.R., Bagby G.J., Nelson S., (2000). Innate immunity and pulmonary host defense. Immunological reviews.173, 39-51. Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10719666
Deep A., Chaudhary U., Gupta V., (2011). Quorum sensing and bacterial pathogenicity: from molecules to disease. Journal of Laboratory Physicians, 3(1), 4-11. doi:10.4103/0974-2727.78553
Byrd M.S., Bing P., Wenzhou H., Elizabeth A., Richard A., Chelsie E., Kristen E.D., Kyle M., … Swords E., (2011). Direct evaluation of Pseudomonas aeruginosa biofilm mediators in a chronic infection model. Infection and Immunity, 79(8), 3087-3095. doi:10.1128/IAI.00057-11
von Rosenvinge E.C., O’May G.A., Macfarlane S., Macfarlane G.T., Shirtliff M.E., (2013). Microbial biofilms and gastrointestinal diseases. Pathogens and disease, 67(1), 25-38. doi: 10.1111/2049-632X.12020
Foreman A., Jervis-Bardy J., Wormald P.J., (2011). Do biofilms contribute to the initiation and recalcitrance of chronic rhinosinusitis? The Laryngoscope, 121(5), 1085-1091. doi: 10.1002/lary.21438. http://dx.doi.org/10.1002/lary.21438.
Nickel J.C., Ruseska I., Wright J.B., Costerton J.W., (1985). Tobramycin resistance of Pseudomonas aeruginosa cell growing as a biofilm on urinary catheter material. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 27(4), 619-624. doi:10.1128/aac.27.4.619
Elaine M.M., Michael O.W., Lauren O.B., (2016). Type IV pilus expression in upregulated in Nontypeable Haemophilus influenzae biofilms formed at the temperature of the human nasopharynx. Journal of Bacteriology, 198(19), 2619-2630. doi:10.1128/JB.01022-15
Zar H.J., Tannenbaum E., Hanslo D., Hussey J., (2003). Sputum induction as a diagnostic tool for community-acquired pneumonia in infants and young children from a high HIV prevalence area. Pediatric Pulmonology, 3(6). doi:10.1002/ppul.10302
Lahti E., Peltola V., Waris M., Virkki R., Rantakokko-Jalava k., Jalava J., Eerola E., Ruuskanen O., (2009). Induced sputum in the diagnosis of childhood community-acquired pneumonia. Thorax, 64(3), 252-257. doi:10.1136/thx.2008.099051
Theophilus K.Adiku, Richard H.Asmah, Onike R., Bamenla G., Evangeline O., Andrew A.Adjei, Eric S.Donkor, George A., (2015). Aethiology of acute lower respiratory infections among children under five years in Accra, Ghana. Pathogens, 4(1), 22-33. doi:10.3390/pathogens4010022
El Seify M.Y., Fouda E.M., Ibrahim H.M., Fathy M.M., Husseiny Ahmed A.A., Khater W.S., El Deen N.N.Abouzeid H.G.,… Elbanna H.S., (2016). Microbial ethiology of community-acquired pneumonia among infants and children admitted to the pediatric hospital, Ain Shams University. European Journal of Microbiology and Immunology, 6(3), 206-214. doi:10.1556/1886.2016.00022.
Bhuyan G.S., Hossain M.A., Sarker S.K., Rahat A., Islam T., Haque T.N., Begum N., Qadri S.K., … Mannoor K., (2017). Bacterial and viral pathogen spectra of acute respiratory infections in under-5 children in hospital setting in Dhaka city. PLoS One, 12(3), e0174488 doi:10.1371/journal.pone.0174488
Hall-Stoodley L., Nistico L., Sambanthamoorthy K., Dice B., Nguyen D., Mershon W.J., Hu F.Z., Stoodley P., …Post J.C., (2008). Characterization of biofilm matrix, degradation by DNase treatment and evidence of capsule downregulation in Streptococcus pneumoniae clinical isolates. BMC Microbiology.8:173. doi:10.1186/1471-2180-8-173
Gilley R.P., Orithuela C.J., (2014). Pneumococci in biofilms are non-invasive: implications on nasopharyngeal colonization. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 4:163. doi:10.3389/fcimb.2014.00163
https://doi.org/10.3389/fcimb.2014.00163.
Chao Y., Marks L.R., Pettigrew M.M., Hakansson A.P., (2014). Streptococcus pneumoniae biofilm formation and dispersion during colonization and disease. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology,4:194. doi:10.3389/fcimb.2014.000194 https://doi.org/10.3389/fcimb.2014.00194.
Shak J.R., Vidal J.E., Klugman K.P., (2013). Influence on bacterial interactions on pneumococcal colonization of the nasopharynx. Trends in microbiology, 21(3), 129-135. doi:10.1016/j.tim.2012.11.005 https://doi.org/10.1016/j.tim.2012.11.005.
Simell B., Auranen K., Käyhty H., Goldblatt D., Dagan R., O’Brien K.L., (2012). The fundamental link between pneumococcal carriage and disease. Expert Reviews of Vaccines, 11(7), 841-855. doi:10.1586/erv.12.53
https://doi.org/10.1586/erv.12.53.
Wu X., Jacobs N.T., Boizo C., Palm P., Lattar S.M., Hanke C.R., Watson D.M., Sakai F., … Vidala J.E., (2017). Competitive dominance within biofilm consortia regulates the relative distribution of pneumococcal nasopharyngeal density. Applied and Environmental Microbiology, 83(16), e00953-17. doi:10.1128/AEM.00953-17
Honkinen M., Lahti E., Österback R., Ruuskanen O., Waris M., (2012). Viruses and bacteria in sputum samples of children with community-acquired pneumonia. Clinical Microbiology and Infection, 18(3), 300-307. doi:10.1111/j.1469-0691.2011.03603.x
Gentile A., Bardach A., Ciapponi A., Garcia-Marti S., P Aruj P., Glujovsky D., Calcagno J.I., Mazzoni A., Colindres R.E., (2012). Epidemiology of community-acquired pneumonia in children of Latin America and the Caribbean: a systemic review and meta-analysis. International Journal of Infectious Diseases, 16(1), e5-e15. doi:10.1016/j.ijid.2011.09.013
"Inter Collegas" є журналом відкритого доступу: всі статті публікуються у відкритому доступі без періоду ембарго, на умовах ліцензії Creative Commons Attribution ‒ Noncommercial ‒ Share Alike (CC BY-NC-SA, з зазначенням авторства ‒ некомерційна ‒ зі збереженням умов); контент доступний всім читачам без реєстрації з моменту його публікації. Електронні копії архіву журналів розміщені у репозиторіях ХНМУ та Національної бібліотеки ім. В.І. Вернадського.
Подача рукопису до редакції означає згоду всіх співавторів на такі умови використання їх твору:
1. Цей Договір про передачу прав на використання твору від Співавторів видавцю (далі Договір) укладений між всіма Співавторами твору, в особі Відповідального автора, та Харківським національним медичним університетом (далі Університет), в особі уповноваженого представника Редакції наукових журналів (далі Редакції).
2. Цей Договір є договором приєднання у розумінні п.1 ст. 634 Цивільного кодексу України: тобто є договором, «умови якого встановлені однією із сторін у формулярах або інших стандартних формах, який може бути укладений лише шляхом приєднання другої сторони до запропонованого договору в цілому. Друга сторона не може запропонувати свої умови договору». Стороною, що встановила умови цього договору, є Університет.
3. Якщо авторів більше одного, автори обирають Відповідального автора, який спілкується із Редакцією від свого імені та від імені всіх Співавторів щодо публікації письмового твору наукового характеру (статті або рецензії, далі Твору).
4. Договір починає свою дію від моменту подачі рукопису Твору Відповідальним автором до Редакції, що підтверджує наступне:
4.1. всі Співавтори Твору ознайомлені та згодні з його змістом, на всіх етапах рецензування та редагування рукопису та існування опублікованого Твору;
4.2. всі Співавтори Твору ознайомлені та згодні з умовами цього Договору.
5. Опублікований Твір знаходиться в електронному вигляді у відкритому доступі на сайтах Університету та будь-яких сайтах та в електронних базах, в яких Твір розміщений Університетом, та доступний читачам на умовах ліцензії "Creative Commons (Attribution NonCommercial Sharealike 4.0 International)" або більш вільних ліцензій "Creative Commons 4.0".
6. Відповідальний автор передає, а Університет одержує невиключне майнове право на використання Твору шляхом розміщення останнього на сайтах Університету на весь строк дії авторського права. Університет приймає участь у створенні остаточної версії Твору шляхом рецензування та редагування рукопису статті або рецензії, наданої Редакції Відповідальним автором, перекладу Твору на будь-які мови. За участь Університету у доопрацюванні Твору Співавтори згодні оплатити рахунок, виставлений їм Університетом, якщо така оплата передбачена Університетом. Розмір та порядок такої оплати не є предметом цього договору.
7. Університет має право на відтворення Твору або його частин в електронній та друкованій формах, на виготовлення копій, постійне архівне зберігання Твору, розповсюдження Твору у мережі Інтернет, репозиторіях, наукометричних базах, комерційних мережах, у тому числі за грошову винагороду від третіх осіб.
8. Співавтори гарантують, що рукопис Твору не використовує твори, авторські права на які належать третім особам.
9. Співавтори Твору гарантують, що на момент надання рукопису Твору до Редакції майнові права на Твір належать лише їм, ні повністю, ні в частині нікому не передані (не відчужені), не є предметом застави, судового спору або претензій з боку третіх осіб.
10. Твір не може бути розміщений на сайтах Університету, якщо він порушує права людини на таємницю її особистого і сімейного життя, завдає шкоди громадському порядку та здоров’ю.
11. Твір може бути відкликаний Редакцією з сайтів Університету, бібліотек та електронних баз, де він був розміщений Редакцією, у випадках виявлення порушень етики авторів та дослідників, без будь-якого відшкодування збитків Співавторів. На момент подачі рукопису до Редакції та всіх етапів його редагування та рецензування, рукопис не має бути вже опублікованим або поданим до інших редакцій.
12. Передаване за цим Договором право поширюється на територію України та зарубіжних країн.
13. Правами Співавторів є вимога зазначати їх імена на всіх екземплярах Твору чи під час будь-якого його публічного використання чи публічного згадування про Твір; вимога збереження цілісності Твору; законна протидія будь-якому перекрученню чи іншому посяганню на Твір, що може нашкодити честі і репутації Співавторів.
14. Співавтори мають право контролю своїх особистих немайнових прав шляхом ознайомлення з текстом (змістом) і формою Твору перед його публікацією на сайтах Університету, при передачі його поліграфічному підприємству для тиражування чи при використанні Твору іншими способами.
15. За Співавторами, окрім непереданих за цим Договором майнових прав та із урахуванням невиключного характеру переданих за цим Договором прав, зберігаються майнові права на доопрацювання Твору та на використання окремих частин Твору у створюваних Співавторами інших творів.
16. Співавтори зобов’язані повідомити Редакцію про всі помилки в Творі, виявлені ними самостійно після публікації Твору, і вжити всіх заходів до якнайшвидшої ліквідації таких помилок.
17. Університет зобов'язується вказувати імена Співавторів на всіх екземплярах Твору під час будь-якого публічного використання Твору. Перелік Співавторів може бути скорочений за правилами формування бібліографічних описів, визначених Університетом або третіми особами.
18. Університет зобов'язується не порушувати цілісність Твору, погоджувати з Відповідальним Автором усі зміни, внесені до Твору у ході переробки і редагування.
19. У випадку порушення своїх зобов'язань за цим Договором його сторони несуть відповідальність, визначену цим Договором та чинним законодавством України. Всі спори за Договором вирішуються шляхом переговорів, а якщо переговори не вирішили спору – у судах міста Харкова.
20. Сторони не несуть відповідальності за порушення своїх зобов'язань за цим Договором, якщо воно сталося не з їх вини. Сторона вважається невинуватою, якщо вона доведе, що вжила всіх залежних від неї заходів для належного виконання зобов'язання.
21. Співавтори несуть відповідальність за правдивість викладених у Творі фактів, цитат, посилань на законодавчі і нормативні акти, іншу офіційну документацію, наукову обґрунтованість Твору, всі види відповідальності перед третіми особами, що заявили свої права на Твір. Співавтори відшкодовують Університету усі витрати, спричинені позовами третіх осіб про порушення авторських та інших прав на Твір, а також додаткові матеріальні витрати, пов'язані з усуненням виявлених недоліків.